Quantum Theory - это шутер от третьего лица в фантастическом сеттинге. Сюжет нам расскажет о последних днях человечества, которое постепенно уничтожает «чума будущего» под названием «Диаблозис». Спасти отстатки людишек вызывается храбрый воин Сид и его очаровательная напарница Филена. Вместе им предстоит штурмовать огромную «живую» башню, в которой и засела зараза, именуемая «Диаблозисом». Живую в первую очередь потому, что архитектура уровней в ней будет меняться в реальном времени - и стенка, за которой вы так хорошо прячетесь и отстреливаете монстров, может в один момент исчезнуть. Короче говоря, ландшафт тут будет меняться очень часто, что будет вынуждать вас идти в атаку. Игрок берет на себя роль Сида - «темного героя» который орудует огромной пушкой и за Филену непокорную героиню, она может использовать меч и пистолет. По сюжету оба товарища пытаются добраться до верхушки огромной башни, преследуя различные цели. Сид хочет уничтожить башню, в то время как Филена хочет встретиться с отцом, по некоторым предположениям он может находиться в верхней части башни.