Действие игры происходит после событий шестой части и между событиями седьмой и восьмой частей. В конце Yakuza 6, главный герой Кадзума Кирю инсценирует свою смерть и скрывается, чтобы защитить своих приёмных детей. Работая на клан Дайдодзи в качестве секретного агента под кодовым именем «Дзорю», Кирю оказывается втянутым в новый конфликт, когда его вынуждает выйти из укрытия таинственная личность.