Игровой процесс Ratatan представляет собой уникальное сочетание ритма и стратегии, где игрок берёт на себя роль «дирижёра», управляющего действиями симпатичной армии персонажей. В Ratatan представлена более современная система движения, при этом разработчики сохранили основы игрового процесса Patapon, который так нравится поклонникам этой серии. Каждая кнопка на контроллере представляет одну из четырёх музыкальных фраз, и их нужно будет нажимать в соответствии с определённым ритмом, чтобы отдавать команды армии. Некоторые персонажи оснащены музыкальными инструментами, которые могут раскрыть особые навыки в бою.