Внимание, трофей глюченый. В локации Old town может не начаться одна из битв, где спрыгиваете в яму и появляются четыре противника и лазеры над головой, за которую дают одно из семян. Либо может быть как у меня, когда я битву проиграл, но после загрузки игра думала, что я ее прошел, но семя не получил. Осторожно, так как это повлечет не получение аж 3 трофеев: Environmentalist, Collector Classics, Liberator.
Видеогайд (en) с seed 4/5.

Подробная карта в хорошем разрешении с расположением всех коллектиблов:

Всего нужно собрать 50 семян, но у меня как-то вышло 51

Дополню. Трофей исправили в патче 1.03