Сюжет новой игры в серии River City будет развиваться вскоре после событий Downtown Nekketsu Monogatari. Здесь, в Академии Рэйхо, заправляет «Большая четвёрка», вселяющая ужас в учеников соседних школ. Её лидер, Масао Кобаяси, кажется жестоким и непобедимым, но на самом деле у него есть скрытая сторона... Однажды, будучи ещё учеником средней школы, Кобаяси познакомился с таинственным парнем по имени Коуки Мидзогути, преследовавшим некую таинственную и опасную организацию. Мидзогути увидел в Кобаяси отголоски какой-то силы, и они подружились. Однако новый друг Кобаяси-куна внезапно исчез — вероятно, был похищен той самой организацией, на которую теперь открыл спокойную, взвешенную охоту наш герой.