Получить обе концовки нужно в одной игре, т.е. сначала "Puppet / Марионетка", а после "Freedom / Свобода".
Чтобы это сделать в одной сесиии/сохранении, вам сначала нужно не открывать пирамиду и пройти концовку, а после уже повторить с открытием пирамиды. При этом у меня не выпал трофей когда я открыл пирамиду не со всеми чернилами.