В Crash Bandicoot: Mind over Mutant странным образом помолодевший Нео Кортекс в очередной раз планирует захватить мир. С помощью своего приятеля Н. Брио злодей реализуют чёрный замысел. Для захвата мира используется новое дьявольское изобретение - устройство, рассылающее особенные текстовые сообщения, управляющие сознанием мутантов и самого героя-бандикута. Крэш должен помешать чудовищным планам и спасти себя и своих друзей - титанов.