Final Fantasy III сочетает в себе элементы двух первых игр, а также свои собственные элементы. В игре присутствует 4 постоянных героя, а также несколько временных (Сид, принцесса Сара, Дэш, Элия, принц Алус и другие). В центре сюжета находится группа молодых людей, которых засасывает кристалл света. Он же даёт им некоторые сверхъестественные способности и приказывает восстановить мировой баланс.