Для получения данного трофея необходимо:

- НИ РАЗУ не использовать очки улучшения ПРАКСИС, будь то взятые на карте, полученные как бонусы за выполнение квестов или полученные при повышении уровня;

- не использовать ни одно оружие, в том числе нелетальное;

- НЕ совершать летальные нейтрализации (для них надо использовать встроенные в локти лезвия, что, видимо, считается использованием имплантов);

- не кидать гранаты, мины и прочие спецсредства.

Насчет средств, повышающих здоровье, запас энергии и прочие полезности - не уверен. Сам лично бегал с пустым инвентарем, так что не пользовался ничем.

ВНИМАНИЕ! Для тех кто будет пытаться открыть все трофеи за одно прохождение: использование Праксиса или Инвентаря даже с предворительным сохранением блокируют трофей Factory Zero. Проверено на собственном горьком опыте

Необходимо полностью отказаться от оружия и улучшений (это возможно), а в случае с КАСИ в конце игры, использовать его через сохранение, уже после получения трофея Factory Zero.

Использование энергетических батончиков так же не влияет. Ещё можно без проблем подбирать оружие, мины, гранаты и комбинировать их, вытаскивать из "кобуры", но ни в коем случае не стрелять. Проверено лично.
На зарубежных сайтах пишут, что использование оглушающего пистолета не обнуляет трофей, но что-то я не уверен.

алкоголь, обезболивающее, гипостим точно не влияют на получение трофея

Использовать аптечки и батончики с энергией можно.

Не пугайте народ!

1. Применял праксис с предворительным сохранением.

2. Применял пару раз оружие, не на людей, с предварительным сохранением.

3. Несколько человек убил руками и даже не стал перегружатся.

Трофей дали в конце.

необходимо и достаточно не пользоваться снаряжением из инвенторя и вкачивать очки праксис. убивать и оглушать всех и вся можно, равно как и активировать сигнализацию.

Очень помогло это прохождение:

https://www.youtube.com/watch?v=ErH1ulv4zjU

Довольно сложно, но можно ниразу не включить тревогу и не засветиться.

Плюс здесь показано как получить все остальное трофеи Missing Link за одно прохождение.