Не берём МО-диски, при стычке с Лизой нажимаем NO, не даём Барри оружие.

Можете проходить игру, спасая всех. Перед тем, как в самом финале, в Лаборатории, пойти и вызволить Криса, сделайте сохранение в отдельный слот. Так вы сможете выполнить и этот трофей, и на спасение всех членов S.T.A.R.S.
Следом игнорируйте спасение Криса, бегите к Барри. В заключительном босс-файте с Тираном позвольте ему убить вашего товарища, только после этого вступите в бой. В последней кат-сцене вы получите трофей за соло-прохождение. После этого загрузите сейв из Лаборатории, спасите Криса и не дайте Тирану убить Барри для получения альтернативного трофея.