По ходу кампании, будут появляться дополнительные задания. Если что-то не выполнили, можно затем переиграть миссию.
Более того, те испытания, что вы выполнили, выполнять заново не нужно.
Видеогид со 100% прохождением всех миссий.

Если встречаются трудности в миссиях, вбивайте в ютуб прохождение каждой главы. В миссиях где нужно проходить по стелсу или никого не убивать, очень помогают такие вещи как "Вырубить врага" (Подкрадываемся сзади, нажимаем , затем удерживать.) и "Помощь грачей" (Просто нанимаете их или если есть улучшение то вызываете, они будут убивать противников и вам засчитают задание. Проверено.). В отличие от остальных частей Assassin's Creed, игру существенно упростили.

100% прогресс нужен только в заданиях сюжетных 9 частей. В остальных миссиях, если дополнительные условия вызывают трудности, их можно не соблюдать. Где требуется никого не убивать, используйте грачей, глючные дротики или нокаут.

Нужно выполнить 100% синхронизацию только сюжетной линии.

Никаких трудностей нет, 100% нужно получить только в истории, остальные задания сторонников и истории Лондона можно проходить не выполняя доп. условия.

Если для 100 % синхронизации нужно выполнить 2 условия, а Вы по какой-то причине выполнили только 1, то при переигрывании надо выполнить только не выполненное.