Сохранять прогресс не обязательно, трофей выпадет итак. Удобно делать сразу после трофея "УЦЕЛЕВШИЕ"

Убил Маркуса в самый последний момент игры, Коннором-машиной, после успешной мирной демонстрации и концовки "Андроиды получили свободу хотя бы на время".

В последней главе Битва за Детройт, когда Коннор в концовке будет говорить в заснеженном саду с Амандой, после разговора НЕ нужно идти к синей панели, достаточно подождать на месте пару минут, Коннор убивает Маркуса.

Можно совместить с трофеем "Я еще вернусь". В конце задания на крыше за Коннора, он заходит в здание и может там пристрелить Норт (если Маркус мертв).

Трофей можно получить тремя способами:
1. Выстрелить в Маркуса/Норт в магазине
2. Когда Маркус нейтрализует солдат у пулемёта у нас появится возможность управлять либо Коннором либо Маркусом. Выбираем вариант "управлять Коннором" и убираем Маркуса в QTE
3. Когда в самом конце игры киберлайф попытается взломать Коннора просто стоим и ничего не делаем. Коннор застрелит Маркуса

Не спасал Норт, выбрал восстание, RK800 остался машиной, по итогу в финальной схватке около лагеря выбрал управлять RK800 и убил Маркуса, после титров выпал трофей.

Если Коннор стал девиантом и они с Маркусом дожили до конца, то можно просто ничего не делать в процессе взлома, тогда Коннор убьет Маркуса во время его речи.
https://www.youtube.com/watch?v=Z_ZPcT-dJFw

Если Маркус умрет до главы "Ночь души", то предводителем девиантов станет Норт. Коннор должен остаться машиной, чтобы в конце главы "Битва за Детройт" он нашел раненную Норт и выстрелил в неё.

Выбил трофей переиграв главу с выключенным сохранением

Если убить Маркуса на Иерихоне, то лидером становится Норт и в последней главе нужно убить и её.

Если решили переиграть контрольную точку, то обязательно включите сохранение, иначе не выпадет троф.
И на всякий случай кидайте сэйвы на флэшку.

Переиграла главу «Ночь души» с выключенным сохранением, как написал пользователь GI8my - трофей выпал после финальных титров.