Троф. особых трудностей не вызвал, чаще собирайте ресурсы, когда пробегаете, и охотьтесь.

В режиме охотника (при нажатии R3) редкие животные оставляют шлейф за собой, обычные просто подсвечиваются желтым.

Некоторые редкие шкуры мне попадались в мешочках, которые разбросаны по всей карте, а также в в главном тайнике иногда появляются. Редкую шкуру рыбы нашел как раз в тайнике.

В настройках можно выставить бесконечное зрение охотника. Что облегчает прохождение.

Некоторые шкуры редких животных можно найти на заданиях Beast Kill или в пещерах.

Для добывания шкур мамонта-проще убивать маленьких(как в начале игры)

Дополню:
1. Возьмите за правило, как только оказались у своей лежанки, то выспитесь до утра. Мешок обновится, и в нем рандомно будут появляться редкие шкуры или камушки.
2. Выполняйте задания на охоту на животных. Там, мало того, что вы при убийстве будете получать шкуры, так еще и после завершения вам их накинут.
3. Чтобы получить шкуры рыб просто плавайте. Иногда коллекционные вещи находятся в речках и водоемах. Если увидите рыбу, то подплывайте к ней чтобы началась катсцена, в которой вы можете рыбу убить.
4. Обязательно первым делом вкачайте в перк на увеличение вероятности появления редких вещей как в мешке, так и при убийствах.
5. Обыскивайте все до появления надписи что уже некуда складывать. Поглядывайте на миникарту (на большой не все показываются) на счет спрятанных/висячих мешков. При зачистке пещер, само собой, собираем все. В 75% там будут вам нужные вещи. Как вы уже сами, наверное, поняли - северные камни на севере, а южные на юге. Вообще, для строительства жилья ресурсы находятся там где вы нашли персонажа.

У меня сложность возника с редкой грызь-рыбой.
Но она у меня появилась два раза в тайнике, в начале и в конце игры, так что чаще спите до рассвета.
Всем мир.

Рядом с вашей деревней висит на дереве один секретный мешок с лутом и это ОБНОВЛЯЕМЫЙ мешок, из которого можно взять одну рандомную редкую шкуру + один рандомный редкий ресурс КАЖДЫЙ раз после сохранения и перезагрузки игры. Так что это что-то вроде огромного чита, т.к. теперь вы можете фармить редкие шкуры и ресурсы до бесконечности, практически не покидая деревни.