Чтобы в одно прохождение получить трофеи за обе концовки сначала выбираем с захватом мира(эту), смотрим катсценки, по их окончании в главном меню жмем continue и нас снова кидает на выбор судьбы мира.
Если сначала выбрать "добрую", то будет босс-баттл и вернуться к развилке в это прохождение уже не выйдет.