Достаточно в конце сделать правильный выбор. В данном случае отключение симуляции.

Правильный выбор сделать недостаточно. Проходить скрытно, не выпускать психов, не поднимать тревогу. 2 полных прохождения минимум на 2 концовки.

Для данной концовки нужно убивать как можно меньше людей. Получите после диалога во время финальных титров.

Даже если вы не получили данный трофей при первом прохождении - ничего не потеряно. Я никого не убивал на протяжении всей игры и трофей все-равно не получил.
После просмотра титров - выходим в главное меню и выбираем Блэка (продолжить). Обратить внимание нужно на следующие моменты:
Решить загадку с вентилями и паром - просто закрываем все вентили против часовой стрелки. (уровень Job for Robert Ramsey);
В псих.лечебнице никого не освобождаем из пациентов. В сцене, когда открывается дверь и на вас побежит псих с трубой - просто быстро забегаем в дверь и поднимаемся выше. (уровень The man from Lithrust Asylum B - обе части);
В лечебнице, когда увидим сцену с психом, который стоит к нам спиной - стреляем в магнитофон;
Спасти Джареда;
Спасти Бойса.
Все эти пункты, кроме лечебницы, можно закончить сразу после выполнения. Но только через телепорт с помощью картины с цифрами 1010101011100. Если нажать выход в меню, то прогресс не сохранится. Итак, после всех вышеописанных процедур, уже выходим из зала с уровнями в меню и запускаем игру за Рэда. На центральном мониторе должна быть указана последняя глава Confession. Запускаем, смотрим ролик и получаем трофей. У меня он выпал именно после того, как проделал вышеописанные процедуры

Первый раз играл в свое удовольствие, поэтому убивал всех подряд, и соответственно в конце игры, когда выбрал вариант отключиться от симуляции, мне все равно выпал не этот трофей, а противоположный. После этого я просто переиграл через главы ключевые моменты в игре, описанные парнем вверху, а точнее: ни кого не убивал, просто пробегал, и спас Джареда и Бойса и Джона и Малома. Трубы, кстати, при переигрывании не крутил, а выстрелил в замок. Все это заняло минут 30. Затем запустил последний файл за Рэда и когда пошли титры игры, данный трофей выпал.
Итог: Можно не заморачиваться с тем, чтобы всю игру никого не убивать, ну и соответствнно нет необходимости проходить игру два раза.

При получении все сделал согласно подсказкам сверху. Также не выпускал пациентов, спас Бойса и Джареда, закрутил вентили и стрельнул в магнитофон. Но остальных пациентов, с трубой и прочих, которые мешали пройти я застрелил. В том числе Малого и Шляпника. Троф все равно выпал после титров

Пришлось перепройти 3 главы никого не убивая. Вернее перепробежать. Абсолютно неважно увидят вас или нет, скрытность не нужна. Просто не убивать и все.
1. Глава с кражей пистолета и лифтами (на верхнем этаже после краже тоже никого не убивать)
2. Глава где вы пробираетесь в дыру в стене. Не забудьте в конце спасти чувака за стеклом
3. Глава на болотах. Тут прокладывайте маршрут по дуге, по правой норм работает, можно пробежать очень быстро все 3 энкаунтера. Второй чуть геморный, но норм.

Далее запускаете Confession за Рэда. Судя по всему неважно выберете ли вы посмотреть еще симуляцию или отключение сразу. Я выбрал отключение два раза. Когда будет закадровый диалог - Грейс будет спокойна, не будет ничего крушить и ломать. Значит вы получили концовку. Трофей дадут как бегущие титры пробегут треть экрана плюс/минус.