Всего в игре три типа кристаллов:

• Маленькие - дают всего один кристалл. Выглядят короткими и пузатыми.
• Средние - дают сразу 10 кристаллов. Выглядят вытянутыми ромбообразными камнями правильной формы. При сборе издают более высокий звон.
• Большие - дают 50 кристаллов сразу. Встречаются реже всех и в основном обособленно. Чаще всего найти их можно под днищем островов. Выглядит самым жирным почти круглым по форме камнем. При сборе издает самый высокий и мелодичный звон.

Как я сказал выше, камни проще всего собирать под днищем островов. И в этом вам очень помогут талисманы синего цвета со свойством увеличения радиуса сбора камней. Вне миссий постоянно носите эти талисманы, чтобы собирать камни эффективнее. Радиус довольно большой и камни зачастую прилетают даже через стенки.
Фармить камни на руде нет никакого смысла - там выпадают только мелкие и фармить придется очень долго. Проходите игру, собирайте камни с уровня и оставьте фарм на фриплей после прохождения сюжетной части. Кристаллы тратятся только на прокачку и не будет никакого смысла собирать их после полной прокачки.
Когда выполните последнюю миссию - можете пособирать камни под островами (они там зачастую восстанавливаются), или перезапустить сюжетную миссию 19, дойти до испытания с в стиле Луны (прыгать по ладоням за девушкой между взрывающихся Неви) и сохраниться в конце его (на последней ладони, не прыгая на последнюю платформу), после чего загрузить запись и пропрыгать все снова. На пути будет 92 средних камня. Прыгать лучше опять таки с талисманами на сбор камней.

19 глава
когда дают силы луны и заставляют скользить по ломающимуся полу. Отличное и ОЧЕНЬ быстрое и простое место для фарма. Видеогайд.

Если вы начали считать сколько нужно гемов для полной прокачки и, увидев сотни тысяч, фрустрировали, беспокоиться не надо — при каждом улучшении уменьшается стоимость последующих апгрейдов, так что в итоге на всё уйдёт всего 87к гемов, а не 100к или 200к.

Загружаем Главу №19
Пропускаем все ролики
Когда миссия начинается, собираем все джемы
После того как собрали все, Сохраняем игру и перезаписываем старое сохранение.
Как только игра сохранилась, Нажимаем загрузить сохранение,
То самое куда вы сохранились только что.
и Загружаем его, Вы Опять появляетесь в начале миссии и можете собирать джемы опять.
Повторять каждый раз и получать джемы для прокачки.
Видеогайд.

Фармить надо чуть дальше, когда дают стиль луны и надо прыгать за незнакомкой по ладоням. Там за один проход собирается 920 кристалов против 270 в начале. Что намного приятней и сильнее сокращает время.

на всю прокачку уйдет 87000 драгоценных камней

Не будет лишним, если вы наденете талисманы на увеличение радиуса сбора камней.