По сюжету нужно будет спрятаться в исповедальне в церкви, в шкафу и в туалете в школе. На трофей не влияет

Думаю, здесь ошибка перевода слова closet - уборная/шкаф, так что лучше ещё и шкафов избегать, но могу и ошибаться; лучшее решение - проходить по какому-нибудь спидрану, прятаться почти не придётся.

Сюжетные моменты в счет трофея не идут, в школе спокойно прячьтесь в туалет когда это понадобится.

В шкафчики вроде тоже нельзя прятаться, не прятался в бочках и туалете, но один раз случайно залез в железный шкафчик в пещерах, когда прячешься от Вэл. Трофей не дали