Смотрите трофей "Complete Vermin Extermination / Истребление вредителей".

Чтобы собрать все файлы, нужно будет пройти игру 3 раза - Сценарий А за любого персонажа (соберёте почти всё), сценарий Б за Клэр (будете находить записки от Леона+играть за Шерри), сценарий Б за Леона (будете находить записки от Клэр+играть за Аду).
Трофей должен выпать в канализации, рядом с фуникулёром, когда будете проходить сценарий Б второй раз за другого персонажа. Если не выпал, значит что-то пропустили. Но в любом случае советую отложить этот трофей на потом. На платину игру придется проходить несколько раз, так что дособираете, вряд ли придется выбивать этот трофей отдельно и что-то искать.
И ещё - если на карте комната обозначается красным цветом, значит там есть предмет. Если синим, значит предметов нет. Но это не распространяется на текстовые файлы. Если комната закрашена синим цветом, то не факт, что там не осталось непрочитанных файлов. Поэтому внимательно исследуйте локации.

Из личного опыта...
Когда будете проходить кампанию за Клэр, не забудьте посмотреть второй этаж приюта. За Шерри не все читабельное можно взять.
Последний файл лично я забыл именно там.
Все остальные заметки, записки и т.д., как правило, лежат в более очевидных и посещаемых местах.

Текстовый гайд.
Общее количество можно посмотреть в разделе Рекорды - Хранитель знаний. Мне помогло т.к. заглянув я увидел что не хватает 3 файла...

Проходил все прохождения А и Б с видосом про все собиралки но на последней не дали ачиву! гдето провтыкал! начал переигрывать все потому что не смог понять где!
Если у кого такая же ситуевина можно легко проверить путем загрузки по очереди последнего сохранения А и Б сценариев. Загрузил гдето в конце открыл инвентарь и глянул что собрано в этом сохранении и сравнил со списком что надо! вышло у меня так что на Б сценарии за Леона провтыкал в комнате старс взять нотки КЛер( а прошел уже почти полтора раза игру заново!