Все коды к сейфам и воротам по главам:
Глава 4: 07-20-13
Глава 8: - код к воротам 0512
Глава 9: 60-23-06
Глава 9: 04-51
Глава 9: 86-07-22
Глава 9: код от ворот 5345
Глава 11: 55-01-33
Глава 13: код от дверцы 15243
Глава 16: 30-82-65
Глава 18: 08-10-83
Глава 18: 38-55-23
Глава 21: 70-12-64
Глава 25: 17-38-07
Глава 28: 68-96-89
Глава 31: 90-77-01
Глава 33: 30-23-04
Глава 34: 12-18-79

Половину сейфов (после того как узнал что так можно) возможно открывать подбором кода, ориентируясь на особый звук при прокрутке замка - специфический щелчок, который отличается от стандартного звука, когда крутите замок.
При определенной сноровке данные "нужные щелчки" будут легко слышны при прокрутке цифр, слегка наклоняя стик или пользуясь d-pad, пока перелистываете цифры с 01 до 99.

Глава 13: код от дверцы 15243 - не обязательно, трофей выпал без нее

Текстовый гайд.

Видеогайд.

У меня при прохождении центра Сиэтла в банке не было в сумке рядом с телом документа с кодом от сейфа. Просто закрыл игру, запустил игру снова, выбрал продолжить игру и записка появилась.