Зачистка всех поселений не только ещё один лёгкий трофей, а ещё это точки быстрого перемещения по миру игры (лагеря больше нет в инвентаре), лучшее оружие и много патронов.
Если идете на 100% в Dlc, то обязательно зачищайте поселения ради упрощения прохождения.