Во время прохождения игры, у вас будут скит сцены и будет выбор вариантов ответа, этот вариант и влияет на отношения между персонажами, я особо не озадачивался, так как игру вам прийдется проходить 3 раза, за 3 прохождения вы должны успеть укрепить все ваши связи со всеми персонажами.

Посмотреть результат можно в статистике персонажа. Листаем в право.