Иногда на миссии (любой, но на финальной миссии основной игры не заметил) будет появляться мини босс Вожак Налётов, это случайно происходит. Убиваем его и с него падает его флаг. Подходим и удерживаем кнопку взятия предмета. Наложится модификатор сложности до конца миссии. Один флаг - один модификатор. Больше флагов набирать нет смысла. Считаются миссии с флагом, а не количество набранных флагов в миссии.